3 февраля 1999 года был издан указ № 672 первого Президента Республики Саха (Якутия) М.Е. Николаева об открытии Института физической культуры и спорта Якутского государственного университета им. М.К. Аммосова.

В настоящее время институт является крупнейшим высшим учебным заведением в России, оснащенным современными спортивными сооружениями, что дает возможность больше перспективы по дальнейшему развитию физической подготовки студентов и развитию спорта в республике. Институт стал передовой кузницей подготовки спортсменов высокого класса. Ежегодно студенты добиваются убедительных спортивных результатов по различным видам спорта не только в республике, но и в Дальневосточном регионе РФ, чемпионатах России и Мира среди студентов.