История развития Института берет свое начало с отделения математики физико-математического факультета Якутского пединститута.  

С открытием в 1956 году Якутского  государственного университета началась усиленная подготовка научно-педагогических кадров по математике, а в 1977 году физико-математический факультет   университета был разделен на два факультета: математический и физический. В 1999 году, по инициативе первого Президента Республики Саха (Якутия) М.Е. Николаева, математический факультет был преобразован в Институт математики и информатики. 

Основной целью нашего института является работа по воспитанию высококвалифицированных кадров по следующим направлениям бакалавриата и магистратуры :