Клинической базой курса «Факультетская хирургия» и «Отоларингология» является - ГБУ РС(Я) «Республиканская больница № 2-Центр экстренной медицинской помощи».
Клинической базой курса «Онкология» является ГБУ РС(Я) «Якутский республиканский онкологический диспансер».
Клинической базой курса «Урология» является ГБУ РС(Я) «Республиканская больница №1 – Национальный Центр Медицины»
Преподавателями кафедры проводится огромная лечебно-консультативная работа больных ГБУ РС(Я) «Республиканская больница № 2-Центр экстренной медицинской помощи», ГБУ РС(Я) «Республиканская больница №1 – Национальный Центр Медицины» и ГБУ РС(Я) «Якутский республиканский онкологический диспансер», а также всех поликлиник г.Якутска.
В сложных лечебно-диагностических случаях преподавателями курса проводятся телемедицинские и выездные консультации и лекции в лечебно-профилактических учреждениях городов и районов Республики Саха (Якутия).