• ЭИОС

Реконструкция предкового гаплотипа с мутацией сайта сплайсинга c.-23+1G>A гена GJB2 в некоторых популяциях Евразии

Руководитель
Соловьев Айсен Васильевич,
м.н.с.  научно-исследовательской лаборатории молекулярной биологии, аспирант ИЕН

Аннотация:
Данный проект направлен на решение важной фундаментальной проблемы о происхождении патогенной мутации сайта сплайсинга с.-23+1G>A гена GJB2, в популяциях Евразии. Недавно, в Республике Саха (Якутия) преимущественно у коренного населения (якутов) была обнаружена мутация сайта сплайсинга c.-23+1G>A, которая в гомозиготном состоянии является причиной врожденной глухоты и встречается с экстремально высокой частотой гетерозиготного носительства в популяции якутов (10,3%). Накопленные в мире данные свидетельствуют о том, что эта мутация встречается не только на территории Восточной Сибири, но и в ряде популяций Восточной Европы [Seeman et al., 2004; Pollak et al., 2006; Toth et al., 2009; Sansovic et al., 2009; Близнец и др., 2012; Minarik et al., 2012; Shubina-Oleinik et al., 2014], Кавказа [Божкова и др., 2008; Близнец и др., 2012], Ближнего Востока [Sirmaci et al., 2006; Bonyadi et al., 2011; Alkowari et al., 2012; Zeinali et al., 2014], Центральной Азии [Tekin et al., 2010] и Южной Сибири [Бады-Хоо и др., 2014]. До настоящего времени остается нерешенным вопрос имеют ли хромосомы несущую мутацию сайта сплайсинга в гене GJB2 единое происхождение. Для того чтобы построить корректные популяционные сценарии о возможных путях миграции носителей мутации с.-23+1G>A в географическом и историческом контексте в настоящем проекте планируется провести анализ структуры неравновесия по сцеплению гена GJB2 у глухих пациентов с мутацией c.-23+1G>A в гомозиготном состоянии из различных популяций Евразии при помощи современных методов и подходов, включая полногеномный анализ. По результатам реконструкции предкового гаплотипа планируется подтвердить или опровергнуть гипотезу о едином происхождении мутации сайта сплайсинга c.-23+1G>A гена GJB2, на территории Евразии.