2 апреля 1934 г. вышло Постановление Наркомпроса РСФСР об открытии якутского и русского от делений в Якутском пединституте, в соответствии с которым в 1935 г. было открыто отделение русского языка, а в 1939 г. – отделение якутского языка. В 1939 г. было принято всего 5 студентов, из них 3 – на отделение якутского языка.В 1939 г. в г. Ленинграде Л.Н. Харитонов защитил кандидатскую диссертацию на тему «Категория наречия в якутском языке» и был назначен преподавателем языка и литературы Якутского государственного педагогического института. Первыми преподавателями отделения были М.С. Гуревич, В.В. Яковлев, Н.С. Григорьев, Н.М. Заболоцкий, Б.А. Павловский, Н.О. Саввин, Х.И. Константинов. В 1946 г. на отделении языка и литературы открылись 2 кафедры. Первым заведующим кафедрой якутского языка и литературы стал Л.Н. Харитонов, до этого работавший инспектором Министерства просвещения, завучем школы, учителем. Л.Н. Харитонов – составитель учебных пособий «Неизменяемые слова в якутском языке» (1943), «Современный якутский язык» (1947), автор научно-методических статей.
В 1947-1962 гг. кафедрой якутского языка заведовал Н.С. Григорьев, защитивший кандидатскую диссертацию на тему «Имена прилагательные в якутском языке» в г. Ленинграде. Н.С. Григорьев является автором многих учебных пособий, внесшим большой вклад в развитие якутского языка, пользовавшийся большим авторитетом среди студентов. В 1974 г. им был издан «Фразеологический словарь якутского языка».
В 1952-1956 гг. заведующим кафедрой якутского языка работал Г.А. Никифоров, написавший кандидатскую диссертацию на тему «Категория множественного числа в якутском языке».
Профессор Н.К. Антонов был заведующим кафедрой якутского языка и литературы в 1962-1968 гг., а также в 1977-1980 гг. В 1953 г. защитил кандидатскую диссертацию на тему «Именное словообразование в якутском языке», а в 1973 г. – докторскую диссертацию на тему «Историческая лексика якутского языка». Н.К. Антонов – автор научных трудов, таких как «Материалы по исторической лексике якутского языка» (1971), «Саха билиҥҥи тылын лексиката» (1967), «Былыргы тюрк тыла» (1970), «Лекции по тюркологии» (1976-1984) и др.
В 1968-1977 гг. и в 1980-1991 гг. кафедрой якутского языка и литературы заведовал профессор Н.Д. Дьячковский. В то время на кафедре работали профессор Н.К. Антонов, доценты П.С. Афанасьев, М.А. Черосов, Н.Н. Неустроев, кандидаты наук И.П. Винокуров, Г.Г. Филиппов, ст. преподаватель А.К. Сивцев, доценты Г.Г. Окороков, А.Е. Захарова, И.Г. Спиридонов, ст. преподаватели Г.Р. Кардашевский, Е.П. Шестаков, В.Н. Протодьяконов. Выпускники кафедры стали проходить стажировку и учиться в аспирантурах других вузов РСФСР и СССР, расширились связи с ИЯЛИ. Научные сотрудники ИЯЛИ Е.И. Коркина, М.С. Воронкин, П.А. Слепцов, Е.И. Оконешников и другие вели преподавательскую работу в ЯГУ. Спецкурсы, лекции для студентов и преподавателей читали известные тюркологи СССР Дж.Г. Киекбаев, В.М. Наделяев, И.А. Андреев, М.З. Закиев, Д.Г. Тумашева, Е.И. Убрятова, В.И. Рассадин и др. Профессором Н.Д. Дьячковским написаны работы «О фонетическом освоении заимствованных слов в якутском языке» (1963), «Звуковой строй якутского языка» (ч. I, 1971, ч. II, 1977), «Саха билиҥҥи тылын фонетиката» (2000) и др.
Отделение якутского языка как самостоятельное подразделение было открыто в составе историко-филологического факультета в 1947 г. А в 1982 г., когда ИФФ разъединился на исторический и филологический факультеты, якутское отделение вошло в состав ФЛФ.
В 1991 г. заведующим объединенной кафедрой якутского языка и литературы был назначен Г.Г. Филиппов. Факультет якутской филологии и культуры создан в 1992 г. решением Ученого Совета ЯГУ от 25 марта 1992 г. с целью подготовки специалистов для обеспечения возрождения и развития якутского языка и культуры народов республики. Приказом ректора В.В. Филиппова от 13 мая 1992 г. деканом-организатором был назначен доцент Г.Г. Филиппов.
В состав факультета, сформированного на базе кафедры якутского языка и литературы филологического факультета, вошло 5 кафедр: кафедра якутского языка (зав. Филиппов Г.Г.), кафедра якутской литературы (зав. Протодьяконов В.Н.), кафедра национальной культуры (зав. Бравина Р.И.), кафедра методики преподавания якутского языка, литературы и национальной культуры (зав. Колодезников С.К.), кафедра психологии (зав. Оконешникова А.П.).
В первый год работы на факультете введена специализация «Национальная культура» для подготовки специалистов по следующим направлениям: «Преподаватель якутского языка и литературы», «Учитель якутского языка в русскоязычных школах», «Учитель национальной культуры», затем были открыты специализации «Саха-английский» (2000), «Саха-турецкий» (2001), «Якутско-русский перевод» (1999), «Литературный работник» (2001). С 1992 г. началась совместная подготовка учителей якутского языка и национальной культуры со средним образованием в Вилюйском педучилище. В 1995 г. факультет начал подготовку кадров по специальности «Культурология. Культура народов РФ». В последующие годы были введены специализации «Артист эстрады» (1995), «Артист разговорного жанра» (2000), «Теория национальной культуры» (2002).
В 1996 г. по инициативе профессора Н.Н. Тобурокова открылся специализированный совет по защите кандидатских диссертаций по специальности 10.01.02 – Литература народов России (якутская литература).
На факультете созданы две учебно-научные лаборатории. Лаборатория по исследованию наследия классиков якутской литературы (зав. Кулаковская Л.Р.) работает с 1999 г. и готовит полное собрание сочинений А.Е. Кулаковского в 9-ти томах. Лаборатория экспериментальной филологии (зав. Алексеев И.Е.) с 2002 г. начала сбор акустической базы данных языка народа саха.
В 2003-2008 гг. деканом факультета якутской филологии и культуры ЯГУ работал В.В. Илларионов, д.ф.н., профессор. Заместителями декана в разное время плодотворно трудились: по научной работе – В.В. Илларионов, П.А. Слепцов, Г.Г. Левин, Л.С. Ефимова, Г.Г. Торотоев; по учебной работе – И.П. Винокуров, З.К. Башарина, С.Д. Егинова, Л.И. Новгородова, Е.С. Жиркова, Е.А. Архипова, Г.А. Захарова; по хозяйственной работе – Г.И. Гурьев; по заочному обучению – И.П. Винокуров, З.К. Башарина, С.Д. Егинова, С.И. Петрова, М.С. Бурцева; по воспитательной работе – В.А. Ноговицын, С.С. Протопопов, Д.В. Пахомова, А.А. Борисова, Т.И. Скрябина, М.В. Трофимова. Учебно-методическую комиссию возглавляли: С.Г. Олесова, Л.П. Григорьева, Г.Г. Торотоев, Л.Е. Манчурина; методистами по очной и заочной формам обучения были К.Т. Куприянова, А.И. Васильева, В.В. Слепцова.
В 2010 г. был открыт Институт языков и культуры народов СВ РФ (приказ ректора от 06.09.2010 г. № 99- ОД) на базе факультета якутской филологии и культуры и кафедры северной филологии филологического факультета Якутского госуниверситета, созданного в 1992 г. для реализации программной задачи Университета по сохранению и развитию языков и культуры народов СВ РФ. Директором института назначен Филиппов Гаврил Гаврильевич.
На данный момент в учебном подразделении функционируют 8 кафедр, 5 научно-исследовательских лабораторий и научно-образовательный центр. В институте плодотворно трудятся 75 штатных преподавателей, в том числе 12 докторов наук, 42 кандидата наук, остепенённость ППС составляет 72 %.
Институт своей образовательной и научно-исследовательской деятельностью вносит огромный вклад в дело возрождения, сохранения и развития языков и культур коренных народов Севера, Сибири и Дальнего Востока Российской Федерации.