Кафедра активно принимала участие в выполнении грантов по фундаментальным исследованиям в области математики Министерства образования РФ, по фундаментальным проблемам математики и механики научной программы «Университеты России» Министерства образования и науки РФ, ведомственной научной программы «Развитие научного потенциала высшей школы», РФФИ по организации и проведению Международных конференций по математическому моделированию с 1994 г. С 2009 по 2011 годы кафедра участвовала в выполнении проекта аналитической ведомственной целевой программы «Развитие научного потенциала высшей школы (2009-2011 годы)».
С 2009 по 2013 годы 3 аспиранта кафедры выиграли грант ФЦП «Научные и научно-педагогические кадры инновационной России» на 2009-2013 «Исследование разрешимости краевых задач для операторно-дифференциальных уравнений смешанного типа» (Соглашение между очным аспирантом Антипиным В.И. и МОиН РФ №14.132.21.1350), «Исследование базисности собственных и присоединенных функций спектральных задач с незнакоопределенной весовой функцией и их приложения» (Соглашение между очным аспирантом Марковым В.Г. и МОиН РФ №14.132.21.1351) и «Исследование корректности нелокальных краевых задач для псевдопараболических и псевдогиперболических уравнений с краевыми условиями интегрального вида» (Соглашение между очным аспирантом Поповым Н.С. и МОиН РФ №14.132.21.1349).
С 2011 г. – выполнении НИР Государственного задания на 2012-2014 гг. Минобрнауки России (проект №4402) и ФЦП «Научные и научно-педагогические кадры инновационной России» на 2009-2013 гг. (ГК 02.740.11.0609). С 2014 по 2016 год кафедра была руководителем проекта №3047/БЧ ГЗ Минобрнауки РФ «Неклассические дифференциальные уравнения, управляемые процессы и их приложения», с 2017 года по настоящее время – участвует в выполнении проекта № 1.6069.2017/БЧ ГЗ Минобрнауки РФ «Краевые задачи для неклассических уравнений с частными производными».
Заведующий кафедрой Попов С.В. – заместитель главного редактора журнала «Математические заметки СВФУ», индексируемого в БД Scopus, член Совета по науке при Главе Республики Саха (Якутия), член диссертационного совета по физико-математическим наукам при СВФУ, член Объединенного ученого совета Академии наук Республики Саха (Якутия) по физико-техническим наукам, координатор секции регионального экспертного совета конкурса РФФИ-Республика Саха (Якутия), главный ученый секретарь Академии наук Республики Саха (Якутия).