В целях повышения качества учебно-методической деятельности, научно-исследовательской и спортивно-массовой работы кафедра МСиСОТ тесно взаимодействует на основании договора о сотрудничестве с организациями и ведомствами:
- Клайпедский университет (Республика Литва);
- Российский государственный университет физической культуры, спорта, туризма и молодежи (Москва);
- Национальный государственный университет физической культуры, спорта и здоровья им. П.Ф. Лесгафта (Санкт-Петербург);
- Чурапчинский государственный институт физической культуры и спорта;
- Министерство по физической культуре и спорту РС (Я);
- Министерство предпринимательства, торговли и туризма РС (Я);
- Министерство по делам молодежи и семейной политики РС (Я);
- Национальный парк «Ленские столбы»;
- Общеобразовательные организации РС (Я);
- Детско-юношескими спортивными школами РС (Я).