Учебно-научная микробиологическая лаборатория Клиники Медицинского института СВФУ

photo.jpg

Иларова Вера Иннокентьевна
Отличник здравоохранения РФ, врач-бактериолог высшей категории.

Адрес:677027 РС (Я), г.Якутск, ул. Кулаковского, 36, 5 этаж.

Телефон (факс): 89241706275, 89241753177

Эл. почта: bio53@mail.ru, naukamed@mail.ru

Сайт: http://www.s-vfu.ru/universitet/rukovodstvo-i-struktura/instituty/mi/klinika/un_mbl/



Научный руководитель:

Ахременко Яна Александровна,

канд. мед. наук, доцент кафедры гистологии и микробиологии, зав. курсом микробиологии МИ СВФУ, врач-бактериолог


Значение клинической, санитарной, молекулярной микробиологии и паразитологии в совершенствовании лечебно-диагностического процесса и решении эпидемиологических вопросов, а также требовательность к оперативности и достоверности лабораторной информации постоянно повышаются. Вместе с тем, несмотря на проводимые мероприятия, в организации и качестве микробиологической диагностики в учреждениях здравоохранения остаются серьезные недостатки. В первую очередь это неудовлетворительное материально-техническое обеспечение лабораторий, которое усугубляется недостатком квалифицированных кадров, отсутствием стандартизованных методов исследования, слабой нормативной базой.

Современные методы микробиологического исследования микробных заболеваний, микрофлоры человека, окружающей среды и пищевых продуктов основаны на применении международных стандартов, новых качественных и количественных методов и инновационных методик, в т.ч. на молекулярном уровне. Все это делает актуальным открытие современной учебно-научной микробиологической лаборатории Клиники Медицинского института СВФУ.

Цель: Учебно-научная микробиологическая лаборатория организована в целях внедрения инновационных подходов в здравоохранении и санитарно-эпидемиологическом исследовании, модернизации учебного процесса в медицинском образовании и привлечения профессорско-преподавательского состава и обучающихся СВФУ к выполнению научно-исследовательских работ по проблемам медицинской микробиологии и микроэкологии.

Основные задачи работы лаборатории:

1. Обеспечение лабораторно-практических занятий с применением современных технологий по курсу микробиологии, вирусологии, иммунологии, санитарной, фармацевтической и клинической микробиологии для студентов, интернов и ординаторов, слушателей малой медицинской академии и курсов повышения квалификации. Лаборатория является учебной базой для новой специальности «Медико-профилактическое дело».

2. Планирование и организация научно-исследовательских работ в области клинической, санитарной и молекулярной микробиологии с привлечением профессорско-преподавательского состава и обучающихся к выполнению работ.

3. Разработка и внедрение в практику современных подходов в диагностике микробных заболеваний, изучения микробного статуса человека, объектов окружающей среды и пищевых продуктов.

4. Разработка инновационных образовательных программ, проектов и учебно-методических комплексов в области медицинской микробиологии для студентов и практического здравоохранения. Внедрение в образовательный процесс результатов научных исследований и экспериментальных разработок.

5. Содействие в подготовке и повышении квалификации научно-педагогических и врачебных кадров в области клинической, санитарной и молекулярной микробиологии.

6. Участие в российских и международных проектах, сотрудничество с ведущими российскими и зарубежными микробиологами, организация конференций и семинаров.

Направления научных исследований:

1. Изучение микробного фенотипа и колонизационной резистентности жителей Севера, закономерностей становления и механизмов нарушения при патологических состояниях, разработка адекватных методов коррекции;

2. Изучение спектра возбудителей различных микробных заболеваний человека в условиях Севера, их чувствительности и механизмов устойчивости к антимикробным препаратам, в т.ч. на молекулярно-генетическом уровне;

3. Изучение антимикробной и пробиотической активности препаратов и БАД, разрабатываемых на основе местного природного сырья; разработка инновационных пробиотических продуктов;

4. Биоиндикация и биомониторинг объектов окружающей среды и разработка подходов к профилактике микробных заболеваний и оздоровлению микроклимата.

Структура лаборатории:

- отдел клинической микробиологии

- отдел санитарно-бактериологических исследований

- отдел молекулярной диагностики

Оснащение лаборатории:

Лаборатория располагает необходимым оборудованием для клинической и санитарной микробиологии, в т.ч. микробиологическим анализатором Vitek II compact (Био Мерье), позволяющим идентифицировать более 200 тыс. видов бактерий и грибов, а также определять их чувствительность к антимикробным препаратам в соответствии с Международными стандартами микробиологического исследования. Имеются термостаты, СО2-инкубаторы, анаэростат, ламинарные боксы, микроскопы, гравиметрический дилютер, магнитная мешалка и др.

Этапы развития и штатное расписание лаборатории:

1 этап – 2011 г – приобретение микробиологического анализатора Vitek II compact (Био Мерье) и передача оборудования ООО «Центр БИО-Диагностика» на баланс СВФУ (всего на сумму 5 млн руб), переход сотрудников в штат Клиники МИ СВФУ. Обучение 3 сотрудников работе на микробиологическом анализаторе.

Заведующий лабораторией – 1 ед

Старший научный сотрудник – 1 ед

Научный сотрудник – 2 ед

Лаборант – 3 ед

2 этап – 2012 г – организация молекулярного отдела – приобретение оборудования на сумму 11 млн руб., повышение квалификации 3 сотрудников и дополнительно:

Врач-бактериолог – 2 ед

Лаборант – 2 ед

Диагностические возможности лаборатории:

• Комплексное исследование микрофлоры дыхательных путей, диагностика микробных заболеваний органов дыхания (носоглотки, мокроты, промывных вод бронхов и др.), диагностика микробных заболеваний ЛОР-органов, глаз;

• Комплексное исследование микрофлоры полости рта, в т.ч. определение спектра кариесогенных и пародонтопатогенных микроорганизмов, диагностика одонтогенных инфекций;

• Определение микрофлоры и бактерицидности кожи; диагностика воспалительных заболеваний кожи;

• Комплексное исследование микробиоценоза мочеполового тракта, диагностика ЗППП, бактериального вагиноза, диагностика уроинфекций;

• Комплексное изучение кишечного микробиоценоза, диагностика кишечных инфекций, включая кампиллобактериоз, выявление энтеровирусов и токсина Cl. difficile, диагностика абдоминальных и анаэробных инфекций;

• Диагностика нейроинфекций, сепсиса, бактериемий, а также системных инфекционных заболеваний, микозов;

• Определение содержания лизоцима и фагоцитарных показателей биологических жидкостей человека;

• Определение чувствительности клинически значимых возбудителей к антимикробным препаратам, анализ механизмов резистентности; определение чувствительности бактерий к препаратам бактериофагов.

• Санитарно-микробиологическое обследование объектов окружающей среды (воздух, вода, смывы), производственный контроль в Клинике МИ СВФУ, лечебно-профилактических учреждениях, объектах общественного питания и пищевых производствах;

• Санитарно-микробиологическое исследование пищевых продуктов: определение патогенов, ГМИ в продуктах, определение содержания пробиотических микроорганизмов в кисломолочных продуктах и др.

• Определение антимикробной и пробиотической активности препаратов и БАД, получение заквасок на основе консорциумов пробиотических микроорганизмов.

• Развитие направления терапии аутоштаммами микроорганизмов.

Все исследования проводятся с использованием одноразовых принадлежностей для взятия материла, в т.ч. с транспортной средой, с применением современных дифференциально-диагностических питательных сред, в т.ч. хромогенных и флюорогенных, тест-систем для ускоренной индикации и идентификации патогенных и условно-патогенных микроорганизмов, что дает следующие преимущества:

- Прием материала для исследования в течение рабочего дня и в выходные дни;

- Удлинение сроков транспортировки (с 2-3 часов до 72);

- Сокращение сроков исследования (от 7-10 сут до 2-3);

- Высокий процент выделения микроорганизмов из исследуемого материала, чистоту выделения и высокую вероятность идентификации (более 80%);

- Бактериологическая, вирусологическая и паразитологическая диагностика в одной лаборатории.

Взаимодействие лаборатории с другими подразделениями МИ и СВФУ:

- Кафедра гистологии и микробиологии

- Кафедра нормальной и патологической физиологии

- Кафедра госпитальной хирургии

- Кафедра инфекционных болезней, фтизиатрии и дерматовенерологии

- Кафедра терапевтической, хирургической, ортопедической стоматологии и стоматологии детского возраста

- Кафедра общей хирургии, травматологии, ортопедии и медицины катастроф

- Кафедра общественного здоровья, организации здравоохранения, экологии человека и ЗОЖ

- Институт последипломного образования врачей СВФУ

- Малая медицинская академия СВФУ

- Биолого-географический факультет

- Ботанический сад СВФУ

- Арктический инновационный центр

Связи лаборатории с другими организациями:

- Институт биологических проблем криолитозоны СО РАН

- ЯГСХА

- НПО «Фтизиатрия»

- Кафедра микробиологии и вирусологии; кафедра иммунологии СибГМУ (г. Томск)

- Кафедра микробиологии РГМУ (г. Москва)

- Кафедра клинической лабораторной диагностики НГМУ (г. Новосибирск)

- Российское общество микробиологов

-Межрегиональная ассоциация клинической микробиологии и антимикробной химиотерапии (МАКМАХ)

- Микробиологическое общество Кореи

РЕЗУЛЬТАТИВНОСТЬ НАУЧНОЙ ДЕЯТЕЛЬНОСТИ

Проведение научно-исследовательских работ (фундаментальных прикладных, хоздоговоров)

Годы

Наименование НИР

Научный руководитель

Объем финансирования

ФИО студентов,

аспирантов,

докторантов, принимавших участие в финансируемых НИР

2012

Грант Президента РС (Я). «Спектр возбудителей внебольничных пневмоний у стационарных пациентов г. Якутска и подходы к антибактериальной терапии.»

Ахременко Я.А.

30.000 руб

Таппахов А.А., Стручкова Е.Н.

2012

УМНИК «Разработка пробиотических продуктов функционального питания с природными иммуномодуляторами»

Ахременко Я.А., Тарасова Л.А.

200.000 руб

2012-2014

Госбюджетная тема №4988 Госзаказа МОиН РФ «Инновационные высокотехнологичные программы укрепления здоровья Северо-Восточного региона РФ»

Пальшин Г.А.

3.000.000 руб

Таппахов А.А., Стручкова Е.Н., Торопова А.Я., Комзин К.В., Пальшин В.Г.

Издание научных монографий и учебных пособий

Годы

Выходные данные

Авторы

2012

Основы клинической микробиологии: учебное пособие – Издательский дом СВФУ, 2012. – 93 с.

Ахременко Я.А.,

Иларова В.И.

2012

Колонизационная резистентность организма человека в норме и при патологии – Новосибирск: Сибирская издательская фирма «Наука», 2012. – 116 с.

Ахременко Я.А., Красноженов Е.П.

Статьи, изданные в журналах ВАК

Годы

Выходные данные статьи

Авторы

2010

Современные подходы к организации научно-исследовательской работы студентов в условиях инновационного развития вуза// Сибирский медицинский журнал. 2010.Том 98.- №7.- С.19-21.

Ахременко Я.А., Слепцов А.П., Пальшин Г.А.

Использование молекулярно-генетических технологий, основанных на ПЦР в диагностике инфекционных заболеваний у новорожденных // Вопросы практической педиатрии №3 т.5., 2010. С. 8-11

Дегтярева Л.А. Володин Н.Н., Кафарская Л.И., Шкопров А.Н., Хохлова Е.В., Шунникова М.Л., Чаплин А.Н., Ефимов Б.А.

Разработка тест-системы для количественной детекции Escherichia coli, Klebsiella sp. и Streptococcus agalactiaе методом ПЦР-РВ в экспресс диагностике перинатальных инфекций " // Инфекционные болезни №2 т.8.2010. С. 10-13.

Дегтярева Л.А. Володин Н.Н., Кафарская Л.И., Шкопров А.Н., Хохлова Е.В., Кулагина Е.В., Ефимов Б.А.

Особенности микрофлоры верхних дыхательных путей у часто болеющих детей в условиях Севера //Журнал инфекционной патологии. – 2010. - №3 (том 17). - 2010 - с. 21-23

Ахременко Я.А., Уарова А.В., Саввина Н.В., Красноженов Е.П.

2012

Анализ спектра возбудителей и их чувствительности к антибактериальным препаратам при внебольничных пневмониях у стационарных пациентов г. Якутска//Клиническая микробиологи и антимикробная химиотерапия. – 2012.. – №2 (том 14). 2012. – С. 15-16

Ахременко Я.А., Таппахов А.А., Стручкова Е.Н.

Статьи, изданные в зарубежных изданиях

Годы

Выходные данные статьи

Авторы

2010

Основные возбудители бактериальных инфекций верхних дыхательных путей у детей в условиях Севера и подходы к антибактериальной терапии // Сборник статей международного симпозиума «Актуальные вопросы педиатрии в свете доказательной медицины». – Далянь (Китай), 2010. – С. 16-18

Ахременко Я.А., Красноженов Е.П.

2011

Peculiarities of Microbic Phenotype and Colonization Resistance of Children in the North Conditions // Proceedings of 2011 International Meeting of the Microbiological Society of Korea, May 12-13, 2011.- Gwangju, Korea. – P. 59-60.

Akhremenko Ya.A., Krasnozhenov E.P.

Наличие охраноспособных разработок

Годы

Авторы

Номер патента, свидетельства, название объекта интеллектуальной собственности

2011

Ахременко Я.А., Ахременко А.К., Пальшин Г.А.

Способ получения сухого оленьего молока, обогащенного бифидобактериями // НХ 1052-ОД от 28.12.2011

Петрова М.Н., Ахременко Я.А., Пальшин Г.А.

Пробиотический творог, обогащенный кальцием// НХ 1052-ОД от 28.12.2011

Ахременко Я.А., Петрова М.Н., Пальшин Г.А.

Ацидофильная паста для приготовления кефира в домашних условиях// НХ 1052-ОД от 28.12.2011

Дегтярева Л.А. Володин Н.Н., Кафарская Л.И., Шкопров А.Н., Хохлова Е.В., Кулагина Е.В., Ефимов Б.А.

Тест система для количественного определения Streptococcus agalactiae в биологическом материале // Патент РФ № №2435853 от 10.11.2011

2012

Ахременко Я.А., Пальшин Г.А., Епанов В.В., Троев И.П., Комзин К.В.

Способ приготовления пробиотика // Патент РФ № 2435423 от 10.12.2011

Защиты диссертаций:

2010 год – Дегтярева Л.А. защитила кандидатскую диссертацию по теме: «Разработка метода экспресс-диагностики перинатальных инфекций на основе количественной оценки содержания ДНК бактерий, колонизирующих организм плода и новорожденного» в диссертационном совете при РГМУ (г. Москва) по специальности 14.03.10 – клиническая лабораторная диагностика, 03.02.03 – микробиология.